朱光斗教授擅长用中西医两种疗法治疗各种难治性皮肤病，对色素性皮肤病、青春痘、女性面部皮炎、小儿银屑病、皮肤紫癜与脱发等有很好的治疗经验，特别是色素性皮肤病的治疗，如对数万例白癜风的治疗，有效经达90%以上，其中面部治愈率80%以上；经对千例黄褐斑（面部色斑）的治疗观察，具有见效快，治愈率高的效果。朱光斗教授组建了中国中西医结合学会皮肤色素病学组，是该学组的创始人，历任该学组的组长与顾问，推进了国内有关色素性皮肤病临床与实验研究。

从事皮肤病的临床、教学、科研工作40余年，积累了丰富的诊治经验。在国内首先应用丹参治疗嗜酸性筋膜炎与硬皮病，也是首先应用昆明山海棠与雷公屯治疗红斑狼疮与天疱疮的研究者之一，首先发现过量服用维生素C诱发白癜风；在国内首先提出白癜风的图形反应；他首提出疏肝解郁活血祛风法治疗白癜风的中医治疗法则。在国内外医学杂志发表论文66篇，编写《白癜风》、《白癜风防治百题》、《色素性皮肤病》三本书。参加编写《中国医学百科全书皮肤病分册》、《皮肤病学》、《现代皮肤病学》、《皮肤病理生理学》、《皮肤病研究》、《家庭用药大全》、《活血化瘀研究》、《中国中医秘方大全》等27本参考书。曾获全国科学大会奖及上海市卫生局科技进步奖。由于在医疗、教学、科研中成绩突出，1991年起享受国务院政府特殊津贴。